新疆的山脉有：北部阿尔泰山脉、南部为昆仑山脉、中部天山山脉。新疆的山脉地形特点是山脉与盆地相间排列，盆地与高山环抱，喻称三山夹二盆。北部阿尔泰山，南部为昆仑山系，天山横亘于新疆中部，把新疆分为南北两半，南部是塔里木盆地，北部是准噶尔盆地。习惯上称天山以南为南疆，天山以北为北疆。
阿尔泰山脉分布于额尔齐斯河以北，东段在蒙古境内，在新疆境内山段属山脉南坡，呈西北至东南走向，长约500公里。山势较低，山脊线海拔约3000米。新疆南部的昆仑山系分布于塔里木沙漠南缘，自西向东包括：中国境内的帕米尔高原，新疆与克什米尔间的喀喇昆仑山及主要在新疆、西藏间的昆仑山脉。
新疆中部的天山山脉，峰峦重叠、气派雄伟，呈东西走向，分隔准噶尔、塔里木两面大盆地，总长2500公里，是亚洲高大山系之一。天山山脉西段在哈萨克斯坦和吉尔吉斯境内，新疆境内的为中、东段长约1700公里，宽200—300公里，由三列平行的褶皱山脉组成，山势细高东底，山体宽广，山脊线海拔4000米以上。
