用python程序输出DNA互补序列,碱基数

 时间:2024-10-30 13:50:19

1、先说简单的,统计DNA长度,碱基数量。输入DNA序列,记得要加引号primer1='GACAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATGTAGAGTAGGGACGCACAGAGGCTGAGTCGTTGTGATCGG'

用python程序输出DNA互补序列,碱基数

2、输出引物碱基总数,在python里就是用len()函数计算字符串长度print('primer1的碱基数:',len(primer1))

3、输出各个碱基的数量,这里使用了一个 .count('')方法,效果是统计字符串内某字符的数量。print('base A:&垆杪屑丝#39;,primer1.count('A'))print('base C:',primer1.count('C'))print('base T:',primer1.count('T'))print('base G:',primer1.count('G'))

用python程序输出DNA互补序列,碱基数

4、互补序谱驸扌溺列的计算。使用 .translate()方法获得互补序列,括号内是采用的翻译列表;使用str.maketrans('','')方法建立翻译坐逃缥卯列表,这里就是互补规则:AT,CG互补table=str.maketrans('ACGT','TGCA')#碱基互补翻译表print(table)Baserc=primer1.translate(table)

用python程序输出DNA互补序列,碱基数

5、注意,这里的序列碱基虽然是互补的,但是方向是同向的,双链DNA是反向互补,所以必须将序列反向。我不知道如何将字符串反向,所以新建了一个序列,反向填充Baserc的字符,然后把序列转化成字符串。

用python程序输出DNA互补序列,碱基数

6、输出序列及其互补序列print('primer1,5->3:',primer1)print('primer1rc,5->3:',rc)

  • python 字符串转列表
  • 求矩估计量和矩估计值和极大似然估计值,详细过程
  • python中如何在字典中添加键值对(元素)?
  • python创建列表
  • 均匀分布怎么求概率密度
  • 热门搜索
    关于消防的手抄报图片 三年级手抄报保护环境 健康与卫生手抄报 保护校园环境手抄报 预防传染病手抄报资料 有关中国梦的手抄报 元旦手抄报内容大全 法律知识手抄报图片 尊敬老人手抄报 追逐梦想手抄报