1、食用百合，又称菜百合，其色泽洁白、有光泽、鳞片肥厚饱满，质地细腻、营养丰富，口味甜美而幽香。药用百合，颜色较之食用百合微黄、缺乏光泽性，性味甘、微苦而平。
2、食用百合有较高的营养价值，可煮粥入饭，是药食兼优的滋补佳品，四季皆可应用，但更宜于秋季食用药用百合有润肺止咳、清心安神、补中益气之功能，能治肺痨久咳、咳唾痰血、虚烦、惊悸、神志恍惚、脚气浮肿等症。经研究，食用百合不能作为药用百合应用临床。
3、两者价格不同，食用百合的价格比药用百合高很多。
4、食用百合的水浸出物及多糖含量大大高于药用百合，这与其甜百合的称号名实相符，且其肉质细腻软糯营养价值高除作美味佳肴外，其尚具有作为保健品开发潜能。
5、产地不同。江苏宜兴、浙江嘉兴、浙江湖州、湖南龙山、湖南隆回、江西万载等，这些产地为药用百合品种。如卷丹，龙牙等。甘肃兰州为食用百合品种，如兰州百合。
