1、在Beyond Compare3或者Beyond Compare4版本中，设置以下步骤。
1.单击任意一个文件夹。
2.会话 -> 会话设置 -> 比较，去掉比较时间戳。
3.会话 -> 会话设置 -> 比较 -> 比较内容，选择基于规则的比较。
4.视图 -> 显示差异。
5.编辑 -> 完全刷新。
具体步骤和截图如下：
1、单击任意一个文件夹，点击左上角菜单栏的“会话”，从下拉框中找到“会话设置”，单击。
2、弹出文件夹比较的会话设备页面，点击“比较”，去掉“比较时间戳”的打钩。
在比较内容中，选择“基于规则的比较”，不要选默认的二进制比较。
具体如下图。选好后点击“确定”。
3、点击菜单栏的“视图”，选择“显示差异”。
4、接着点击菜单栏的“编辑”，选择“完全刷新”。等待对比结果即可。
5、比较完成后，可以发现有差异的文件不再是因为UNIX、PC或Mac的差异了。
问题解决。
