1、设立主体不同。独资企业的设立时自然人，而不能是法人，公司的设立既可以是自然人，也可以是法人。
2、财产关系不同。独资企业的全部财产归出资者个人所有，公司的财产归公司所有，而不是归个人所有。
3、经营管理主体不同。独资企业有业主对企业进行经营管理，公司一般是由法人治理机构进行管治。
4、承担的责任不同。独资企业的投资人对企业的债务承担无限责任，并且是投资者个人的全部财产清偿债务，公司作为拥有独立财产的法人，对其债务独立承担责任，股东以其出资额为限对公司承担责任。
5、法律地位不同。独资企业中，直接拥有民事权利，诙戢呲剽承担民事义务的是投资者个人，不是独立的民事主体，不具有法人资格，不是法人企业。公司具备法人的实质条件，是具有法人的经济组织，是典型的法人
