如何高效地使用药物靶点预测系统

 时间:2024-10-11 21:04:15

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如何高效地使用药物靶点预测系统

2、创建任务进入系统后,点击创建,弹出任务创建框。有图可见,任务创建包括绘制/导入结构、选择预测方法、相似值及活性分子库等参数。

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3、选择参数-绘制/导入结构首先,在右边窗口绘制或者导入本地结构,既可以点击“添加”,通过内嵌于系统的结构编辑器ipmDraw绘制结构;也可以点击“导入”,添加本地结构文件(mol/sdf格式)。

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4、选择参数——选择预测方法及相似值添加结构后,可以根据自己的需求合理地选择预测方法及相似值。系统提供二维/三维相似度算法,建议选择二维相似度时,相似值滤鲇魍童设置为70%较为合适;选择三维相似度时,相似值设置为60%较为合适。

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5、选择参数——选择活性分子库接着,根据自己的需求选择活性分子库。系统提供两类,一种是药物库,已上市的药物集,约2600多个,数据量较少;两外一种是配体库,公开发布的活性小分子集(包括文献、专利等),约七十万多个。若想得到更多的预测结果,活性分子库建议选择配体库

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