1、综合办公室是年度预算管理的主管部门，负责年度预算的汇集、编制、报批、发布，指导各单位、维护所的预算管理工作。
2、综合办公室是月度预算管理的职能部门，负责月度计划的汇总与发布，对月度预算执行情况进行分析与考核。
3、运营中心是维护所专业预算的管理部门，负责各类专业计划的拟定、报送、组织实施，对预算情况进行监督，并对预算的编制质量负责。
4、相关职能单位负责专业建议预算的拟定，并对预算的编制质量负责：
综合办公室负责招待费、邮电费用、业务宣传费、报刊费用预算等；
财务科：各项财务指标预算、综合预算等；
工程科：基本建设投资预算，土建维修预算及对外机械、人工租赁费用，安全、消防设施预算，环保投入预算等；
设备材料科：设备、物资采购预算，机电设备的更新改造、购置、维护、修理计划，车辆费用预算、防汛物资库维护管理费用等；
运营中心：购买服务收入预算，日常维护预算等；
技术中心：劳动工资预算，人力资源预算，员工培训预算，办公费、印刷费用预算，劳动保护费预算等。
